Analyse protéomique bactérienne - INRA de Clermont-Ferrand - Theix, UR454 Microbiologie
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PROTEINES IDENTIFIEES
Description

Numéro d'accession SWISS-Prot

MM (kDa)

pI

catégorie fonctionnelle selon listilist

 

Signal peptide prédit

 

 Système de sécrétion prédit Localisation prédite

Theo

Exp

Theo

Exp
Protéines de virulence                  
Listériolysine O (Thiol-activated cytolysin) (LLO) Hly (HlyA) (LisA) Lmo0202   4.5 SPI-24 Sec EC
56.0 45.0 7.17 9.17
56.0 57.6 7.17 7.62
56.0 59.0 7.17 7.46
56.0 57.6 7.17 7.29
56.0 58.7 7.17 7.94
56.0 48.9 7.17 8.21
Phosphatidylcholine phospholipase C, PlcB (prtC) Lmo0205   2.4 SPI-25 Sec EC
30.6 31.5 6.86 7.37
30.6 34.4 6.86 7.24
30.6 32.1 6.86 7.25
30.6 32.0 6.86 7.63
30.6 34.1 6.86 7.94
30.6 33.2 6.86 7.93
30.6 33.7 6.86 8.28
30.6 34.6 6.86 7.15
30.6 31.0 6.86 9.08
30.6 35.1 6.86 6.69
30.6 33.9 6.86 6.21
Cell-wall hydrolase, protein of 60 kDa (P60), invasion associated protein, Iap Lmo0582   1.1 SPI-25 Sec EC
48.0 48.9 9.22 8.21
Manganèse-superoxide dismutase, MnSOD Lmo1439   4.2     EC-CP
22.6 27.0 5.23 5.09
22.6 28.9 5.23 5.36
22.6 26.8 5.23 5.23
22.6 26.7 5.23 5.26
Internalin C, (InlC), with LRR (Leucine-rich repeat) Lmo1786   1.9 SPI-33 Sec EC-CP
29.5 32.1 5.47 5.89
29.5 33.9 5.47 6.21
Transport membranaire                  
ABC-Type amino acid transport/signal Transduction system, substrate-binding protein family 3 component, surface adhesion Lmo2349   1.2 SPII-20 Sec EC
27.5 31.5 6.07 9.05
27.5 32.2 6.07 6.07
Dégradation et biogénèse de la paroi cellulaire              
Peptidoglycan lytic protein P45 (protein of 45 kDa), Spl (secreted protein with lytic property) Lmo2505   1.1 SPI-27 Sec EC
39.9 48.9 7.81 8.21
39.9 47.2 7.81 6.78
Transcriptional regulator Lmo0443   3.5.2 Unc-SP Sec EC
34.1 28.8 9.05 6.09
Sec-translocated protein of unknown function with LysM domains Lmo2522   1.1 SPI-24 Sec EC-CW
26.8 28.8 5.29 6.09
Division cellulaire                  
Sporulation stage V, protein G; SpoVG2 Lmo0197   1.7     CP
11.4 12.9 4.52 4.34
Cell cycle protein GpsB Lmo1888   5.2     CP
12.9 10.8 4.52 4.42
Enzyme de dégradation                  
Formylmethionine deformylase Lmo1051   3.8     CP
20.6 26.0 5.12 5.09
Lipoprotein of unknown function Lmo1068   6 SPII-19 Sec EC
28.7 28.2 5.41 7.63
Short chain dehydrogenase Lmo1830   5.2     CP
20.9 27.4 5.91 5.99
Peptidase S14, ClpP Lmo2468   4.1     CP
21.6 26.0 4.94 5.09
Peptidase M23 Lmo2504   1.8 SPI-25 Sec EC
44.5 53 5.71 5.86
Réponse aux stress                  
DNA-binding protein, ferritin-like, Dps type; Fri Lmo0903   4.1     CP
18 19.8 4.82 4.85
Thioredoxin; TrxA Lmo1233   1.4     CP
18.1 22.8 5.21 5.23
Chaperonin GroES Lmo2069   3.9   NC EC-CP
10.1 9.2 4.59 4.48
Thiol peroxidase Lmo1583         4.2     CP
18.1 22.8 5.21 5.23
Terminaison                  
transcription antitermination protein NusG Lmo0246   3.5.4     CP
19.9 24.7 5.16 5.17
Traduction                  
Ribosome recycling factor; Frr Lmo1314   3.7.5     CP
20.8 27.7 5.25 5.23
30S ribosomal protein S4 Lmo1596   3.7.1     CP
22.7 28.3 10.06 4.87
Ribosomal protein S30Ae/σ54 modulation protein Lmo2511   5.2   NC EC-CP
21.6 26.0 5.25 5.09
50S ribosomal protein L5 rplE Lmo2620   3.7.1     CP
20.0 25.1 9.02 9.23
Voies métaboliques                  
6-phosphofructokinase, PfkA Lmo1571   2.11     CP
34.4 39.3 5.46 5.47
34.4 39.1 5.46 5.65
Purine nucleoside phosphorylase DeoD Lmo1856   2.3     CP
25.4 28.0 4.87 4.73
Nucleoside diphosphate kinase; Ndk Lmo1929   2.3     CP
16.4 18 5.21 5.09
Glyceraldehyde-3-phosphate Dehydrogenase; Gap Lmo2459   2.1.2   NC EC-CP
36.3 43.1 5.20 5.38
Uracil phosphoribosyl transferase upp Lmo2538   2.3     CP
22.9 28.4 5.70 5.94
Dihydroxyacetone kinase Lmo2696   2.1.1     CP
21.5 26.0 5.13 5.09
Unc-SP indique la prediction d'un peptide signal non clivé et prit en charge par YidC. SPI et SPII signifient qu'un peptide signal de type 1 ou 2 est prédit. Le nombre d'acides aminés du peptide signal prédit suit cette nomenclature.
Protéines prédites comme impliquées dans la voie de sécrétion (Sec) et non classique (NC).
Prédiction des localisations subcellulaires: EC: extracellular, CW: cell wall, MB:membrane and CP: cytoplasm
Contacts :  Michel Hébraud - Ingrid Chafsey

Dernière mise à jour : 23 Juillet, 2012

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